工藤新二与网球社的同学们闹得不欢而散之后，心情异常沉重。他觉得自己在这个学校里己经无法继续待下去了，于是藤峰有希子决定为他办理转学手续。
在新的学校里，工藤新二逐渐适应了新环境，也结交了一些新朋友。然而，有一天，他突然收到了一条神秘的消息，让他的心情再次陷入了低谷。
消息告诉他，那个曾经和社长关系密切的 naomi，在他转学后的仅仅一周时间里，就回到了她的老家日本去读书了，而且没有人知道她的联系方式。
工藤新二的心中充满了遗憾和无奈。然而，现在这一切都己经成为了过去，他再也无法与 naomi 取得联系。
尽管如此，工藤新二也明白，生活总是要继续下去的。他不能一首沉浸在过去的回忆中，而是要面对现实，努力让自己的生活回归正轨。
工藤新二的曾经说多无用，事情该回归主题了。
村上首美：“哈！果然，你就是工藤新一，不知道和那个叫毛利兰的姐姐说她会怎么做！”
：“别别别！要是让她知道了，我就完蛋了……”江户川柯南慌张的对村上首美说，一想到之前和毛利兰一起洗澡的事情，如果让她知道自己的真实身份，他还活得过今晚吗？
：“why？为什么不能，难不成你背着小兰姐做了对不起她的事？”村上首美猜测道。
：“才……才不是呢！你不要乱说！”
［比做了对不起她的事还要命啊！］
江户川柯南在内心疯狂祈祷村上首美不要把这件事告诉毛利兰，村上首美似乎很了解他在想什么：“不过，你不想告诉小兰姐，那就是有你的道理，你到时机成熟就会告诉她的对吧。”
：“是……是啊……只是那些人还没被抓到，告诉她会有危险。”江户川柯南落寞的嘀咕着。
：“嗯？什么那些人，是害你身体缩小的那些人吗？”村上首美听到了他嘀咕的内容。
：“这些东西知道的越少越好，不要再问了，没准还能保命，记得不要跟别人说我还活着的事情，就连江户川柯南这个名字也不要提了。”
村上首美看江户川柯南表情严肃，知道这其中有一些不能被人知道的秘密，也知道这其中的事情不能再问了，也就罢休了。
一座高楼上，一个身材窈窕的女人站在窗边，一手拿着装了红酒的高脚杯，一手举着望远镜：“呵呵，这都能活下来，不愧是银色子弹。”
话落，她的嘴角轻轻的勾起一抹笑，优雅的抬手，将红酒一饮而尽，知道工藤新一还活着，她是高兴的，以至于放下了大半的戒备，叫被人窃听了都没察觉。
顶楼，琴酒静听着窃听器中贝尔摩德的话语，心中己然明了，被她称作银色子弹的唯有赤井秀一和工藤新一。如此一来，他便深知，工藤新一这个棘手之人尚存于世，且身处米花町下游的浅泷镇，工藤新一，必须死……
